在1949年前的清华校园里，教授治校。教授们可以在思想不受禁锢的环境下进行独立的研究，发表学术成果也不会受到官方的限制。学生们可以自由地选择喜欢学科。学校鼓励学生独立思考和发表对学术和社会问题的观点和看法。和其它所有的大陆大学一样，1949年以后的清华校园里，无论是学术研究，教学课程设置还是行政管理都是在党委的控制之下。官方实行“独尊马列，罢黜百家”。用马列毛思想对知识分子进行所谓思想改造，对学生进行政治洗脑。
